本發(fā)明涉及基因工程,特別是涉及glyma.11g239200基因在鑒定大豆不育突變體中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、大豆是重要的糧食作物以及油料作物,對我國的作物發(fā)展具有重要的經(jīng)濟價值。隨著全球環(huán)境變化和人口的持續(xù)增長,人們對豆類作物的需求不斷增加,但與其他作物產(chǎn)量相比大豆產(chǎn)量還是較低的,因此提高豆類作物產(chǎn)量成為需要攻克的重大難題。
2、大豆是一種自花授粉作物,通過人工異花授粉來生產(chǎn)大量雜交種子十分困難,而雄性不育為雜種優(yōu)勢的利用提供了新思路和重要材料,可以采用雄性不育突變體來制備大豆雜交種子。有助于加速大豆育種的進程。因此,亟需挖掘大豆的不育基因,來應(yīng)用于大豆種子生產(chǎn)和作物改良。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的是提供glyma.11g239200基因在鑒定大豆不育突變體中的應(yīng)用,以解決上述現(xiàn)有技術(shù)存在的問題。本發(fā)明篩選得到了與大豆不育突變體相關(guān)的glyma.11g239200基因,并鑒定到該基因33350509bp處存在t/a突變。經(jīng)過kasp標記驗證實驗證實,glyma.11g239200基因的突變類型可以影響大豆的育性,能夠鑒定大豆不育突變體植株,為大豆種子生產(chǎn)和作物改良提供了技術(shù)支持。
2、為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供了如下方案:
3、本發(fā)明提供一種與大豆育性相關(guān)的glyma.11g239200基因,所述glyma.11g239200基因的核苷酸序列如seq?id?no.1所示。
4、本發(fā)明還提供一種用于鑒定大豆育性的分子標記,所述分子標記的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,在所述核苷酸序列的第12位堿基處存在t/a突變;
5、所述分子標記的參考基因組為wm82.a2.v1基因組。
6、本發(fā)明還提供上述分子標記在早期鑒定大豆不育突變體中的應(yīng)用。
7、本發(fā)明還提供一種用于檢測上述分子標記的kasp引物組,所述kasp引物組包括如seq?id?no.4所示的上游引物glyma.11g239200_f、如seq?id?no.5所示的上游引物glyma.11g239200_h和如seq?id?no.6所示的下游引物glyma.11g239200_r。
8、本發(fā)明還提供一種用于檢測上述分子標記的試劑盒,所述試劑盒中包含上述kasp引物組。
9、本發(fā)明還提供上述kasp引物組或上述試劑盒在早期鑒定大豆不育突變體中的應(yīng)用。
10、本發(fā)明還提供一種早期鑒定大豆不育突變體的方法,包括如下步驟:
11、以待測大豆植株的基因組dna作為模板,利用上述kasp引物組或上述試劑盒對模板進行pcr擴增,pcr擴增完成后讀取熒光信號,解析轉(zhuǎn)換熒光信號,鑒定基因型,根據(jù)基因型判斷待測大豆植株的育性;
12、若鑒定的基因型為tt基因型,則判斷待測大豆植株為可育植株;若鑒定的基因型為aa基因型,則判斷待測大豆植株為不育突變植株。
13、進一步地,所述pcr擴增的反應(yīng)體系為10μl:dna模板1μl、kasp?pcr?mix?5μl、引物混合物0.14μl、ddh2o?3.86μl;
14、所述引物混合物由30μm上游引物glyma.11g239200_f、30μm上游引物glyma.11g239200_h和90μm下游引物glyma.11g239200_r按照體積比1:1:1混合得到。
15、進一步地,所述pcr擴增的反應(yīng)程序為:94℃預(yù)變性15min;94℃變性20s、61-55℃復(fù)性/延伸60s,共10個循環(huán),每次循環(huán)降低0.6℃;94℃變性20s、55℃復(fù)性/延伸60s,共26個循環(huán)。
16、本發(fā)明還提供上述kasp引物組或上述試劑盒在分子標記輔助選育大豆不育突變體中的應(yīng)用。
17、本發(fā)明公開了以下技術(shù)效果:
18、本發(fā)明采用基于bsa-seq法對導(dǎo)致產(chǎn)生大豆不育突變體的基因進行篩選,篩選得到了與大豆不育突變體相關(guān)的glyma.11g239200基因,并鑒定到該基因33350509bp處存在t/a突變。經(jīng)過kasp標記驗證實驗證實,glyma.11g239200基因的突變類型可以影響大豆的育性,根據(jù)該位點設(shè)計kasp引物,能夠鑒定大豆不育突變體植株,為大豆種子生產(chǎn)和作物改良提供了技術(shù)支持。
1.一種與大豆育性相關(guān)的glyma.11g239200基因,其特征在于,所述glyma.11g239200基因的核苷酸序列如seq?id?no.1所示。
2.一種用于鑒定大豆育性的分子標記,其特征在于,所述分子標記的核苷酸序列如seqid?no.1所示,在所述核苷酸序列的第12位堿基處存在t/a突變;
3.權(quán)利要求2所述的分子標記在早期鑒定大豆不育突變體中的應(yīng)用。
4.一種用于檢測權(quán)利要求2所述分子標記的kasp引物組,其特征在于,所述kasp引物組包括如seq?id?no.4所示的上游引物glyma.11g239200_f、如seq?id?no.5所示的上游引物glyma.11g239200_h和如seq?id?no.6所示的下游引物glyma.11g239200_r。
5.一種用于檢測權(quán)利要求2所述分子標記的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒中包含權(quán)利要求4所述的kasp引物組。
6.權(quán)利要求4所述的kasp引物組或權(quán)利要求5所述的試劑盒在早期鑒定大豆不育突變體中的應(yīng)用。
7.一種早期鑒定大豆不育突變體的方法,其特征在于,包括如下步驟:
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,所述pcr擴增的反應(yīng)體系為10μl:dna模板1μl、kasp?pcr?mix?5μl、引物混合物0.14μl、ddh2o?3.86μl;
9.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,所述pcr擴增的反應(yīng)程序為:94℃預(yù)變性15min;94℃變性20s、61-55℃復(fù)性/延伸60s,共10個循環(huán),每次循環(huán)降低0.6℃;94℃變性20s、55℃復(fù)性/延伸60s,共26個循環(huán)。
10.權(quán)利要求4所述的kasp引物組或權(quán)利要求5所述的試劑盒在分子標記輔助選育大豆不育突變體中的應(yīng)用。