本發(fā)明屬于酶工程領(lǐng)域,特別涉及一種酶活提高的pet水解酶突變體及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、聚對(duì)苯二甲酸乙二醇酯(pet)是一種廣泛應(yīng)用于包裝材料、合成纖維和塑料容器等工業(yè)領(lǐng)域的熱塑性聚酯,其具有良好的熱穩(wěn)定性和化學(xué)惰性,難以在自然環(huán)境中降解。隨著pet制品消費(fèi)量的持續(xù)增長,其廢棄物在環(huán)境中長期累積,成為廢塑料污染的重要來源。盡管pet具有回收利用潛力,但現(xiàn)有回收方式仍存在明顯局限。目前pet的回收方式主要包括機(jī)械回收和化學(xué)回收兩類。機(jī)械回收通過物理方法實(shí)現(xiàn)pet再利用,操作簡便,但材料多次回收后性能易下降,限制了其在高性能制品中的應(yīng)用?;瘜W(xué)回收則通過水解、醇解等反應(yīng)將pet降解為其單體或低聚物,可實(shí)現(xiàn)材料的再生合成,但該類方法普遍存在工藝條件苛刻、能耗高及副產(chǎn)物處理難度大的問題。
2、相較而言,酶催化降解pet因具有反應(yīng)條件溫和、產(chǎn)物明確、環(huán)境友好等優(yōu)點(diǎn),在相關(guān)領(lǐng)域被提出作為替代方案。已知pet水解酶(petase)可在適宜溫度和ph條件下斷裂pet分子中的酯鍵,生成對(duì)苯二甲酸(tpa)與乙二醇(eg)等降解產(chǎn)物。已有研究表明,來源于 ideonella?sakaiensis的petase與mhetase可協(xié)同實(shí)現(xiàn)pet的分解,在生物催化降解技術(shù)中具有代表性。然而,天然petase在酶催化效率、熱穩(wěn)定性和底物適應(yīng)能力等方面仍存在不足,難以適應(yīng)高底物濃度、長時(shí)間反應(yīng)或較高溫度等工業(yè)條件。為提升其性能,已有研究采用定向進(jìn)化、理性設(shè)計(jì)等酶工程方法開發(fā)改良型酶變體,其中以fast-petase為代表的突變體在活性與穩(wěn)定性方面均較天然酶有所改善,已成為當(dāng)前酶法pet降解技術(shù)中的重要工具(lu?h.,?diaz?d.?j.,?cuisinier?m.,?et?al.?machine?learning-aided?engineeringofhydrolases?for?pet?depolymerization?[j].?nature,?2022,?604(7907):?662-667.)。但fast-petase在特定應(yīng)用環(huán)境下仍存在反應(yīng)效率不足、酶穩(wěn)定性優(yōu)化空間有限等問題,尚需進(jìn)一步優(yōu)化其性能,以滿足實(shí)際應(yīng)用需求。
3、鑒于此,特提出本發(fā)明。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、為了克服現(xiàn)有技術(shù)的缺點(diǎn)與不足,本發(fā)明的目的在于提供一種酶活提高的pet水解酶突變體及其應(yīng)用。本發(fā)明結(jié)合深度學(xué)習(xí)模型設(shè)計(jì)與酶工程優(yōu)化策略,開發(fā)了更適應(yīng)工業(yè)應(yīng)用需求的高性能pet水解酶突變體。
2、本發(fā)明的目的通過下述技術(shù)方案實(shí)現(xiàn):
3、一種酶活提高的pet水解酶突變體,其氨基酸序列為seq?id?no.1經(jīng)如下任意一種突變而得:
4、s213t、t140d\s213t、s169a\s213t或n212e\s213t;其中,s213t,即第213位氨基酸由s突變?yōu)閠,其他同理;
5、一種所述突變體的編碼基因。
6、上述突變體相關(guān)的生物材料,為下述生物材料中的任意一種或多種組合:
7、(1)含有上述編碼基因的表達(dá)盒;
8、(2)含有上述編碼基因的重組表達(dá)載體;
9、(3)含有(1)中所述表達(dá)盒的重組表達(dá)載體;
10、(4)含有上述編碼基因的重組菌;
11、(5)含有(1)中所述表達(dá)盒的重組菌;
12、(6)含有(2)或(3)中所述重組表達(dá)載體的重組菌。
13、進(jìn)一步的,(2)、(3)中所述重組表達(dá)載體的出發(fā)載體為pet系列的載體或ppiczα載體等;優(yōu)選為pet-22a(+)載體或ppiczαa載體。
14、進(jìn)一步的,(4)、(5)、(6)中所述重組菌對(duì)應(yīng)的宿主菌選自原核生物、酵母或高等真核細(xì)胞等;所述原核生物包括埃希氏菌屬( escherichia)、芽孢桿菌屬( bacillus)、沙門氏菌屬( salmonella)、假單胞菌屬( pseudomonas)或鏈霉菌屬( streptomyces)等細(xì)菌;所述酵母包括畢赤酵母等酵母。更具體而言,所述原核生物是埃希氏菌屬,優(yōu)選大腸桿菌( escherichia?coli, e.?coli),具體可為大腸桿菌bl21(de3)或大腸桿菌origami?2(de3);所述酵母是畢赤酵母x33或gs115。
15、上述突變體、編碼基因、突變體相關(guān)的生物材料在制備酶活提高的pet水解酶突變體中的應(yīng)用。
16、進(jìn)一步的,上述突變體、編碼基因、突變體相關(guān)的生物材料在降解pet中的應(yīng)用。
17、優(yōu)選的,所述pet的結(jié)晶度為20%以下,進(jìn)一步為5~20%,再進(jìn)一步為6~8%;更進(jìn)一步為6.7%。
18、一種獲得上述突變體的方法,包括如下步驟:通過定點(diǎn)突變技術(shù)對(duì)編碼氨基酸序列如seq?id?no.1所示的pet水解酶的基因進(jìn)行定點(diǎn)突變后表達(dá),得到pet水解酶突變體。
19、進(jìn)一步的,通過定點(diǎn)突變技術(shù)向編碼氨基酸序列如seq?id?no.1所示的pet水解酶的基因中引入突變,經(jīng)測(cè)序正確后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌中進(jìn)行表達(dá),得到pet水解酶突變體。
20、本發(fā)明相對(duì)于現(xiàn)有技術(shù)具有如下的優(yōu)點(diǎn)及效果:
21、本發(fā)明從fast-petase出發(fā),基于深度學(xué)習(xí)的設(shè)計(jì)、酶工程優(yōu)化及應(yīng)用展開研究。首先,采用cpd-resnet50深度學(xué)習(xí)模型預(yù)測(cè)并結(jié)合人工評(píng)估,選擇了11個(gè)可能提升酶性能的待驗(yàn)證單點(diǎn)突變體,隨后進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證、酶工程改造。構(gòu)建基于分泌表達(dá)體系和模式底物4-硝基苯基乙酸酯( p-npa)的高通量petase酶活篩選方法,以相對(duì)酶活大于0.5(突變體/fast-petase)和相對(duì)熱穩(wěn)定性大于1.0(突變體/fast-petase)為標(biāo)準(zhǔn),篩選出8個(gè)優(yōu)勢(shì)單點(diǎn)突變體;進(jìn)而構(gòu)建并評(píng)估含2~8個(gè)突變位點(diǎn)的247個(gè)組合突變體文庫,綜合挑選較優(yōu)的單點(diǎn)突變體和組合突變體,以非晶態(tài)pet膜(amopet,結(jié)晶度6.7%)為底物進(jìn)行評(píng)估獲優(yōu)勢(shì)突變體?;诳汕懈钭跃奂瘶?biāo)簽法(csat?2.0)高效表達(dá)純化了該優(yōu)勢(shì)突變體,最優(yōu)突變體t140d\s213t酶活是fast-petase的2倍,在50℃熱處理2小時(shí)后的熱穩(wěn)定性與fast-petase相當(dāng)。對(duì)最優(yōu)突變體t140d\s213t進(jìn)行蛋白質(zhì)熔解溫度(tm)測(cè)試顯示,其tm提高1℃。
1.一種酶活提高的pet水解酶突變體,其特征在于,所述突變體的氨基酸序列為seq?idno.1經(jīng)如下任意一種突變而得:
2.一種編碼權(quán)利要求1所述酶活提高的pet水解酶突變體的基因。
3.權(quán)利要求1所述酶活提高的pet水解酶突變體相關(guān)的生物材料,其特征在于,為下述生物材料中的任意一種或多種組合:
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的生物材料,其特征在于:
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的生物材料,其特征在于:
6.權(quán)利要求1所述酶活提高的pet水解酶突變體、權(quán)利要求2所述基因或權(quán)利要求3~5任一項(xiàng)所述生物材料在制備酶活提高的pet水解酶突變體中的應(yīng)用。
7.權(quán)利要求1所述酶活提高的pet水解酶突變體、權(quán)利要求2所述基因或權(quán)利要求3~5任一項(xiàng)所述生物材料在降解pet中的應(yīng)用。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的應(yīng)用,其特征在于:所述pet的結(jié)晶度為20%以下。
9.一種獲得權(quán)利要求1所述酶活提高的pet水解酶突變體的方法,其特征在于,包括如下步驟:通過定點(diǎn)突變技術(shù)對(duì)編碼氨基酸序列如seq?id?no.1所示的pet水解酶的基因進(jìn)行定點(diǎn)突變后表達(dá),得到權(quán)利要求1所述酶活提高的pet水解酶突變體。
10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的方法,其特征在于,通過定點(diǎn)突變技術(shù)向編碼氨基酸序列如seq?id?no.1所示的pet水解酶的基因中引入突變,經(jīng)測(cè)序正確后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌中進(jìn)行表達(dá),得到權(quán)利要求1所述酶活提高的pet水解酶突變體。